通風柜的通風方式是按照通風系統的范圍和動力來區分的，各分為兩種。
一、按照它的通風系統動力可分為機械通風和自然通風：機械通風就是依靠風機的動力使空氣流動，自然通風就是利用室外的壓力造成熱壓的差別，讓空氣流通。
二、從整個通風系統的作用范圍可分為局部通風和全面通風。
全面通風是對整個房間進行通風換氣，用送入室內的新鮮空氣把房間里的有害氣體濃度稀釋到衛生標準的允許范圍以下，同時把室內污染的空氣直接或經過凈化處理后排放到室外大氣中去。實驗室全面通風一般采用頂部風口排風。 
實驗臺局部通風是采取局部氣流，使局部地點不受有害物的污染，從而造成良好的工作環境。
實驗室局部通風一般包含：通風柜排風、萬向抽氣罩排風、桌面通風罩排風等。